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平成21--25年度:
文部科学省・科学研究費補助金・新学術領域研究「医用画像に基づく計算解剖学の創成と診断・治療支援の高度化（略称：計算解剖学）」計画研究21103003
「計算解剖学の基盤技術」（代表）.
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平成21--23年度:
文部科学省・科学研究費補助金・基盤研究(B) 21300068
「統計アトラスに基づく３次元医用画像からの線状・面状構造の自動抽出と解剖学的同定」(代表).
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平成18--20年度:
文部科学省・科学研究費補助金・基盤研究(B)18300059
「３次元医用画像の多重解像度局所構造解析に基づく線状・面状構造の精密復元と高次処理」(代表).
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平成15--17年度:
文部科学省・科学研究費補助金・基盤研究(B)15300059
「３次元医用画像からの分岐導管構造・薄面構造の自動モデリングと信頼度つき精密定量化」(代表).
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平成15--18年度:
文部科学省・科学研究費補助金・特定領域研究「多次元医用画像の知的診断支援」計画研究 15070207
「人体臓器構造の知的モデリング」(分担)
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平成12--14年度:
日本学術振興会・科学研究費補助金・展開研究(基盤研究)(B)(2)12558033
「形状変形を伴う軟組織手術ナビゲーションシステムの開発」(代表).
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平成11--15年度:
日本学術振興会・未来開拓学術研究推進事業
「外科領域を中心とするロボティックシステムの開発」(JSPS-RFTF99I00903)
「多次元画像解析プロジェクト」(平成11--12年度:コアメンバー)．
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平成11--13年度:
日本学術振興会・科学研究費補助金・一般研究(基盤研究)(C)(2)11680389
「多重方向・多重解像度フィルタを用いた
3次元医用画像の局所構造識別と定量化」(代表).
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平成10--11年度:
科学技術庁・科学技術振興調整費：
大項目「省際ネットワークを利用した医療研究支援アプリケーションの調査研究」,
中項目「データの認識と公開方式の標準化に関する調査研究」,
担当項目「センシブルヒューマンデータの形態・機能的認識・表示に関する研究」
(分担).
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平成10年度:
(財)大阪対ガン協会・ガン研究助成奨励金
「3次元超音波画像を用いた
腫瘍切除および生検ナビゲーションシステムの開発」(代表).